Es la más conocida e importante de las antiguas poblaciones prehispánicas de la región Humahuaca. Se halla situado en una posición de privilegio en la parte central de la Quebrada, donde ocupa un montículo de unos 70 metros de altura sobre el Río Grande, que allí corre a 2.450 m.s.n.m. Las ruinas cubren su total superficie de alrededor de 15 ha.
El Pucará domina un cruce de caminos: la Quebrada de Humahuaca lleva por el sur a las ricas tierras de los valles meridionales y por el norte a las desoladas mesetas andinas;

La Quebrada de Huichairas es por occidente ruta para la Puna y el Guasamayo marca el principio del camino que, trastornando cerros, va a los valles orientales y a las llanuras del Chaco.

Fue un lugar ideal para defenderse de los ataques que podían venir de cualquier rumbo, por un lado acantilados sobre el río Grande, por otro ásperas laderas y en los faldeos más accesibles tuvieron murallas bien construidas. Sobre éstas apoyaron sus viviendas que, escalonadas, constituían una serie de baluartes, los cuales era necesario ir tomando, uno a uno, con grandes pérdidas para los asaltantes que avanzaban al descubierto. Rodeado por el RíoGrande, el cauce del Guasamayo y por un pequeño valle en el sur y este, el Pucará semeja un castillo dispuesto a prestar su refugio a los comarcanos a la primera señal de alerta de los vigías instalados en sus atalayas. En su época de esplendor, debió estar densamente poblado y en sus caminos internos, lugares ceremoniales, casas y reductos bullía la vida en todos sus aspectos. Hoy, varios siglos después que los indígenas tuvieron que abandonarlo, brinda al visitante emociones diversas que emanan del poder evocativo de la ruina y del magnífico ambiente geográfico en que se encuentra.

El Descubrimiento del Yacimiento, en su verdadero valor científico, se debe al Dr. Juan B. Ambrosetti, Director del Museo Etnográfico de la Facultad de Filosofía y Letras de la Universidad de Buenos Aires quien llegó en compañía del Dr. Salvador Debenedetti, llegó a Tilcara en 1908 en una de sus expediciones arqueológicas . Durante los veranos de tres años consecutivos se dedicaron a la exploración de las entrañas del Pucará y tanto de sus cementerios, como de sepulcros ubicados en las viviendas extrajeron unas tres mil piezas. Estos materiales junto con las preciosas observaciones recogidas les permitieron formarse una idea de cómo había sido la vida indígena, antes de la llegada de los blancos en aquella apartada región de la Argentina. En la última campaña mientras en lo que parecía ser una estéril ladera cubierta de pencas iba surgiendo un conjunto de construcciones reveladoras del esfuerzo e inteligencia de los indígenas, Debenedetti tuvo la idea de restaurar las ruinas de la antigua población, aprobada la sugestión por el Dr. Ambrosetti se procedió a limpiar el terreno en una extensión de unos dos mil metros cuadrados y levantar las paredes hasta una altura de poco más de un metro. Limitado en superficie y características este meritorio trabajo de reconstrucción fue debidamente elogiado por los especialistas y agradecido por los millares de visitantes que en el correr de los años llegaron al Pucará.
Debenedetti, no estaba del todo satisfecho, y muerto su distinguido maestro, el Dr. Ambrosetti, varias veces se propuso continuar la obra con planes más ambiciosos.
En el verano de 1929 realizó una nueva exploración complementaria del Yacimiento, pero desgraciadamente en Octubre de 1930, cuando sólo tenía 46 años de edad, se produjo su lamentado fallecimiento que dejó frustrada la magna empresa. Durante casi veinte años el Pucará quedó abandonado, aunque siempre muy visitado y también violado por excavadores clandestinos que mucho mal hicieron a la ciencia.
El 27 de Agosto de 1948, se donó a la Facultad las Tierras del Pucará y una parcela vecina , para no solo reconstruir las ruinas sino también edificar en sus cercanías un Museo Arqueológico. Luego se empezó la obra que contó con la colaboración de la Universidad de Buenos Aires, de los Gobernadores Jujeños y del Ejército.

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